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基于深度学习分割与影像组学特征的直肠癌淋巴结转移派别研究

发布时间: 2022-04-11 09:18:22 浏览:

评价结果。结果表明,针对连贯性较差且形变各异的直肠肿瘤,Unet网络效果优于Vnet。

关键词:Unet;Vnet;分割模型;Dice评价结果

引言

近年来,人工智能与图像处理的快速发展推动了医疗影智能像诊断的变革,定义肿瘤上的影像特征在结直肠癌的临床应用中有着重要作用[1]。人工智能与医学影像的结合,已经成为医生诊断、治疗工作的一种必备手段[2]。人工智能+医学影像是计算机在医学影像的基础上,通过深度学习与大数据技术等,完成对影像的分类、目标检测、图像分割和检索工作,协助医生完成诊断、治疗工作的一种辅助工具,重点是用来提升医生看病效率和准确率[3]。

1 数据预处理

常规的CT扫描图包含内容组织过多,价值信息过少,本文将其转化为HU值图像,HU的取值与设备无关,不同范围之内的值可代表不同器官,用于突出图像的有用信息,增强图像的对比度的作用,便于后续的分割算法。

将DICOM图像中的像素值转化为CT值,直肠CT值一般在40~70 Hu之间,得到HU图像如图1所示(中间为HU图像)。

之后运用公式:

对得到的图像进行0-1归一化,再用双线性插值法进行图像缩放,减少加载内存。

2 分割模型建立

2.1 2D分割模型

首先,将所有数据存为numpy格式文件,并将所有数据进行压缩(每个样本25—30张,样本与样本之间叠加),生成一个n*512*512(或者n*128*128)的文件,在加载数据的时候从n层中任意抽取batch_size(每次训练图片个数)个图片,结合mask(二值化图像)进行U-net训练(使用二维卷积),得到分割模型。

2.2 3D分割模型

本文先将数据整理为mhd文件,将一个样本的所有dicom文件压缩成一个mhd文件每次加载batch_size个mhd,结合mask进行训练(使用三维卷积),得到分割模型。

3 模型分割结果

本文基于pytorch对上述病例图像进行分割,得出如下结果:

4 结论

本文基于对直肠癌病灶的自动分割,建立直肠癌CT影像特征与淋巴结转移情况之间的相关性模型分析。本文首先进行了数据预处理,将直肠CT影像灰度值转为以放射剂量HU显示的图像,并对其进行0-1归化,然后选取26个样本作为测试集,81个样本为训练集,分别构建二维分割网络(Unet)与三维分割网络(Vnet)模型对直肠CT影像进行肿瘤分割,得出相应的掩模图像与Dice评价结果。结果表明,针对连贯性较差且形变各异的直肠肿瘤,Unet网络效果优于Vnet,其中门脉期分割效果最优,Dice值为65.4。

参考文献

[1]魏炜,刘振宇,王硕,et al.影像组学技术研究进展及其在结直肠癌中的临床应用[J].中国生物医学工程学报,2018,37(05):4-11.

[2]谢玉凯,卢桂馥.基于L1范数的特征提取算法研究[J].兰州文理学院学报(自然科学版),2017(5):52-65

[3]郭树旭,马树志,李晶,张惠茅,孙长建,金兰依,刘晓鸣,刘奇楠,李雪妍.基于全卷积神经网络的肝脏CT影像分割研究[J].计算机工程与应用,2017,53(18):126-131.

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